Paleontološke zbirke ukupno broje 12.401 primjerak.

• - Paleobotanička zbirka Gasperini broji 234 primjerka.
• - PALEOBOTANIČKA ZBIRKA GOLUBIĆ, VLADOVIĆ, ŽEVRNJA broji 112 primjeraka.
• - Paleontološka zbirka beskralješnjaka R. Gasperinija broji 2.726 primjeraka.
• - Paleontološka zbirka beskralješnjaka P. Novaka, A. Cvitanića broji 108 primjeraka.
• - Paleontološka zbirka beskralješnjaka V. Golubića, B. Kokana, N. Ževrnje broji 2215 primjeraka.
• - Paleontološka zbirka kralješnjaka broji 521 primjerak.
• - Specijalna zbirka amonita Gornjeg skita V. Golubić broji 4.668 primjeraka.
• - Zbirka anizičkih amonita V. Golubić broji 425 primjeraka.
• - Paleontološka zbirka Ladinik V. Golubić broji 954 primjerka.
• - Zbirka koštanih breča kvartara broji 438 primjeraka.
• - Zbirka špiljske fosilne faune kvartara N. Ževrnja - u osnivanju.

Botaničke zbirke Prirodoslovnog muzeja Split (NHMS) sastoje se od zbirki morskih algi i zbirki višeg bilja. Do sada ove zbirke ukupno broje 16.711 herbarijskih primjeraka. Pošto je dio zbirki u obradi ovo nije konačan broj herbarijskih primjeraka.

• Algarij – novi u osnivanju broji 87 primjeraka herbariziranih algi.
• Algarij G. B. Sandri - broji 38 primjeraka herbariziranih algi.
• Algarij M. S. de Cattani - broji 104 primjerka herbariziranih algi
• Herbarijska zbirka C. Studniczke - broji 20.121 primjeraka herbariziranih biljaka (zbirka je u obradi)
• Herbarijska zbirka A. Andrića - broji 2623 primjerka herbariziranih biljaka
• Herbarijska zbirka G. Bučića - broji 123 primjerka herbariziranih biljaka (zbirka je u obradi)
• Herbarijska zbirka A. Cvitanića - broji 893 primjerka herbariziranih biljaka (zbirka je u obradi)
• Ampelografska zbirka S. Bulića - broji 155 primjeraka herbariziranih listova vinove loze
• Karpološka zbirka - broji 129 primjeraka

Zoološke zbirke broje 121.318 primjeraka.
Morski beskralježnjaci

• · Malakološka zbirka don B. Cvitanovića – 57.325 primjeraka
• · Malakološka zbirka P. Novak, J. Savo, A. Cvitanić, M. Kolander, V. Golubić – 12.911 primjeraka
• · Malakološka zbirka obitelji Bakotić – 6.146 primjerak
• · Zbirka bodljikaša (Echinodermata) U. Girometta – 139 primjeraka
• · Zbirka žarnjaka (Cnidaria) Girometta-Cvitanović – 84 primjerka
• · Zbirka Glavonožaca (Cephalopodae) – 32 primjerka
• · Zbirka mahovnjaka (Bryozoa) – 144 primjeraka
• · Zbirka rakova (Crustacea) – 468 primjeraka
• · Zbirka spužvi (Spongia) U. Girometta, V. Golubić – 66 primjeraka

Morski Kralježnjaci

• · Ihtiološka zbirka – 393 primjerka

Kopneni beskralježnjaci

• Entomološke zbirke E. Karaman, P. Novak – 35.562 primjerka

Kopneni kralježnjaci

• · Zbirka gmazova Girometta-Cvitanić – 300 primjeraka
· Zbirka gmazova Jure Skejić – 176 primjeraka
• · Zbirka gmazova – 36 primjerka
• · Zbirka vodozemaca Girometta-Cvitanić – 27 primjerka
• · Zbirka vodozemaca Jure Skejić – 63 primjeraka
• · Zbirka vodozemaca – 9 primjeraka
• · Ornitološka zbirka – 1.237 primjeraka
• · Oološka zbirka Crnković, Ževrnja – 5.173 primjerka
• · Osteološka zbirka – 364 primjerka
• · Zbirka sisavaca – 137 primjeraka